Съдържание
Западното попиване е една от най-често срещаните процедури в биохимичните лаборатории. По принцип тя разделя протеините от пробата по размер, след което се тества с помощта на антитела, за да се определи дали даден протеин присъства. Полезно е не само в научни изследвания, но и в медицински или диагностични лаборатории; тестовете както за ХИВ, така и за лаймска болест, например, включват тест за свързан с ензим имуносорбент (ELISA), последван от Western blot, ако тестовете ELISA са положителни. Въпреки популярността си обаче, Western blotting има няколко недостатъка.
Nonquantitative
Класическите западни петна не са качествени. С други думи, макар че могат да кажат на изследователите дали даден белтък присъства, те не правят възможно количественото определяне на част от протеина. Някои биотехнологични компании сега продават комплекти, които позволяват на изследователи или лаборантки да определят количеството на наличния протеин, използвайки стандартна крива - но това работи само ако са налични чисти проби от един и същ протеин. Освен това, молекулното тегло на протеин може да бъде оценено само с Western блотиране, а не да бъде определено точно както при мас-спектрометрията.
Антитела
Уестърн блот може да се извърши само ако са налични първични антитела срещу белтък от интерес. Въпреки че антитела за много различни протеини се предлагат от биотехнологичните компании, те не са евтини; ако първичните антитела не са налични за даден протеин, няма да е възможно да се извърши вестерн блот, който търси този конкретен протеин. Нещо повече, изследователите може да искат да определят дали протеинът е бил модифициран по някакъв начин - ако е фосфорилиран (имала фосфатна група към него), например - и с метода на Western blot се нуждаят от антитела, специфични за модифицирания протеин.
обучение
Правилното изпълнение на Western blot може да бъде предизвикателно и да се получат добри резултати, така че персоналът трябва да бъде добре обучен.В това, както и в много други, опитът е може би най-добрият учител; дори за опитен техник, обаче, западното петно отнема много време. Например, частта от гел електрофорезата на експеримента обикновено отнема от един до два часа. Други задачи могат да се изпълняват, докато гелът работи, но експериментът все още отнема доста време, за да получите резултати.
Други ограничения
Антителата понякога могат да проявят известно свързване извън целта, което може да доведе до по-лоши резултати. Освен това, с Western blot използвате антитяло срещу специфичен протеин, така че резултатите ще ви кажат само ако този протеин е присъствал. Масова спектрометрия с висока разделителна способност разкрива всички протеини, присъстващи в пробата, и за разлика от класическото западно блотиране, тя е количествена. Важно е да се помни, разбира се, че масовата спектрометрия е много по-скъпа, а също и по-трудна за техническо използване в сравнение със западното блотиране.