Съдържание
През 19 век таксономията - класификацията на живите организми - беше яростта в биологията. Както любителите, така и професионалните натуралисти бяха толкова увлечени в манията за събиране и идентифициране на същества, че редки бръмбари бяха горещи стоки. По онова време малко се знаеше за микроорганизмите и тяхното място в света на живите същества, а класификацията на микробиологията не отделя толкова внимание. През изминалите десетилетия се наблюдава драстично нарастване на познанията за микробите и методите за идентифициране на микроорганизми, като част от това увеличение е демонстрирано от ефективната класификация на микроорганизмите.
Компоненти на таксономията
Таксономията има три компонента: номенклатура, класификация и идентификация. Номенклатурата просто приписва име на вид. Класификацията е групиране на видовете заедно по споделени характеристики - някои от тях са физически, а други биохимични. При идентифицирането се използват характеристики на организма, за да се определи къде принадлежи в класификационна схема. Съвременната таксономична схема има най-голямата, най-приобщаващата група, домейните. Най-малката група са видовете. От най-приобщаващите до най-специфичните, нивата протичат така: домейн, царство, тип, клас, ред, семейство, род и вид. Вие например сте Eukarya Animalia Chordata Mammalia Primate Hominidae Homo sapiens.
Микроорганизми и домейни
Микроорганизмите са изключително разнообразни. Те не са определени от някакъв конкретен вид структура или функция, а просто от техния размер. Микроорганизмите са толкова разнообразни, че попадат в трите от различните класификации на най-високо ниво - и в трите домена. Единият домен е бактерии, другият е архея, а крайният е еукария. Всички членове на домейните на бактериите и археите са едноклетъчни микроорганизми. Те са и двете клетки без мембрани, отделящи генетичния си материал от останалата част на клетката - мембрани, които определят ядро. Така че всички царства, фила, класове, ордени, семейства, родове и видове в домейните на бактериите и археите са микроорганизми.
Едноклетъчни протестисти
Еукария са организми, чиито клетки съдържат ядро. Много еукариотни организми са едноклетъчни микроорганизми, но много други - като дървета от червено дърво или вие - не сте. Затова са необходими допълнителни класификации. Царството Протиста в областта Еукария се състои само от едноклетъчни микроорганизми. Протиците се разделят на три различни групи от фила: четири различни фила от водорасли, четири различни протолии и две различни плесени. Но всички организми в рамките на тези фила - всички в царството Протиста - са микроорганизми.
Микроскопични гъбички
Царството гъби се съдържа в областта Еукария. Някои от филата в гъбичките съдържа микроорганизми. Например, типът Zygomycota съдържа микроскопични форми за хляб, а типът Ascomycota съдържа дрожди и микробни вредители и паразити. Лишеите са симбиотичен сбор от гъбички и фотосинтетичен организъм - съдържат се частично в царството Гъбички и отчасти в други царства, или дори други области.