Съдържание
Учените имат способността да секвенират молекулата на ДНК; с други думи, те могат да определят реда на нуклеотидните бази във всяка дадена молекула. Разделянето на молекулата на ДНК може да бъде първата от редица стъпки, необходими, за да се разбере как специфичните нуклеотиди в молекулата на ДНК взаимодействат помежду си и кодират различни характеристики в организма. Процесът на секвениране на ДНК е по-скоро включен, но автоматичните ДНК секвенсиращи намаляват човешкото участие, необходимо поне за част от процеса.
Приготвяне на пробата
За да работи автоматичен секвенсор на ДНК, той трябва да открие четирите нуклеотидни бази, които съставят ДНК: аденин, гуанин, тимин и цитозин. Учените копират парче ДНК много пъти и използват рестрикционни ензими, за да нарязват ДНК на парчета с различна големина. След това добавят малко количество флуоресцентна база, маркирана към всяка партида ДНК. Основата, която е или аденин, тимин, гуанин или цитозин, ще се свърже с основната си добавка в края на кичура. Например, аденинът ще се свърже към нишките, завършващи с тимин, а гуанинът ще се свърже към нишките, завършващи с цитозин.
Автоматична конструкция на ДНК секвенсор
Автоматичен ДНК секвенсор е изграден подобно на ДНК секвенсиращ, изискващ повече ръчен труд. По-конкретно, автоматичен ДНК секвенсор е резервоар с дължина около 1 фут с 96 гел ямки, в които може да се налива ДНК. В автоматичен ДНК секвенсър, както във всеки секвентор на ДНК, ДНК се инжектира в гелните гнезда в горната част на резервоара и отрицателен заряд се прилага към този край на резервоара. Отрицателният заряд осигурява силен тласък на нишките на ДНК да изминат различни разстояния до края на резервоара.
Автоматично инжектиране
Автоматичен ДНК секвенсор инжектира партиди ДНК автоматично в горната част на гела. Като такъв, той спестява на изследователите огромно количество време и усилия. След инжектиране на партидите секвенсърът автоматично прилага отрицателен заряд в единия край на резервоара, причинявайки нишките да мигрират на различни разстояния през гела. Различните разстояния отразяват различните размери на ДНК нишките, преминаващи през гела.
детектор
Много автоматични машини за секвениране на ДНК са създадени, за да открият флуоресцентното багрило по нишките на ДНК, преминаващи през гела. По този начин те могат да идентифицират нуклеотидите, които са в краищата на нишките, и да ги запишат в компютъра. Обаче секвенсорите, в най-добрия случай, представят объркана версия на ДНК нуклеотиди. След като използвате автоматична машина за секвениране на ДНК, трябва да преминете през процес, наречен "довършване", при който комбинация от компютри и изследователи сортират резултатите от откриването на ДНК веригата, за да съберат данните в изчерпателно описание на ДНК верига. Не е изненадващо, че този процес може да отнеме много повече време от действителния процес на секвениране.