Съдържание
Учените могат да разграждат или секвентират ДНК в съставните му нуклеотиди, които например могат да кажат на човек дали има генетично заболяване. Обичайните методи за извличане на ДНК включват използването на изопропанол или етанол в един етап от процеса. Въпреки това, клетките съдържат много други молекули като протеини и липиди и учените естествено искат да получат възможно най-чист разтвор на ДНК.
Методите за извличане на ДНК обикновено включват няколко етапа: клетките трябва да бъдат разрушени, мембранните липиди трябва да бъдат отстранени и ДНК трябва да бъде отделена от протеини, РНК и други замърсители. Два типични протокола са алкален лизис за екстракция на бактериална плазмидна ДНК и екстракция на фенол-хлороформ. И при двата метода утаяването на етанол или изопропанол на нуклеинови киселини е един от последните етапи. След като ДНК или РНК се утаят (изпаднат от разтвор), могат да се ресуспендират във вода.
Етанолът е добър разтворител
И етанолът, и изопропанолът се смесват добре (могат да се смесват с) вода, но те имат по-ниски диелектрични константи от водата, което означава, че способността им да защитават положителните и отрицателните заряди в разтвора и да ги държат разделени е много по-бедна. Диелектричната константа за водата например е 78,5, докато константата за етанола е 24,3. ДНК е заредена отрицателно, така че тя е привлечена от положителни йони в разтвора като калий или натрий. Етанолът има по-лоша способност от водата да държи положително заредените йони и ДНК отделно.
Етанолът увеличава концентрацията на ДНК
Етанолът също прави ДНК по-малко разтворима по друга причина. Тъй като молекулите на етанола могат да образуват взаимодействия, наречени водородни връзки с водни молекули, те намаляват броя на водните молекули, достъпни за хидратиране на ДНК. Между този ефект и долната диелектрична константа, етанолът по същество кара ДНК да се агрегира с положителни йони в разтвора, образувайки твърдо вещество или утайка на дъното на епруветката. Утаяването на ДНК служи за по-концентрирането й, тъй като другите замърсители в разтвора не се утаяват едновременно.
Допълнителни фактори в процеса
Измиването с етанол също служи за отстраняване на замърсители с ниско молекулно тегло като соли и детергенти. Избраната сол може да варира в зависимост от това дали е необходимо да се утаи детергентът на натриев додецил сулфат (SDS) от по-ранен етап; Калиевият додецил сулфат, например, е неразтворим и се утаява, така че използването на калиев ацетат в алкален лизис може да премахне SDS преди да се добави етанол / изопропанол. Етанолът също може да се използва за утаяване на РНК по същите причини, въпреки че утаяването на РНК обикновено изисква повече етанол.